Миссия Центра — проведение передовых научных исследований, разработка и производство и реализация современных биологических препаратов. Мы стремимся внедрять инновационные технологии, обеспечивать высокое качество и эффективность отечественной продукции, способствовать развитию биотехнологической науке, здравоохранению, сельского хозяйства и внесению вклада в экономику страны

Основным предметом деятельности Центра является проведение фундаментальных и прикладных научных исследований в области микробиологии и вирусологии, разработка и внедрение в практику микробных и вирусных препаратов для медицины, сельского хозяйства, пищевой промышленности и защиты окружающей среды, подготовка научных кадров в области микробиологии и вирусологии.

Ключевым стратегическим направлением деятельности Центра является развитие передовых исследований в области микробиологии, вирусологии и биотехнологии, направленных на решение актуальных задач здравоохранения, сельского хозяйства, экологии и обеспечения биологической безопасности.

Основные направления научной деятельности Центра:
·            изучение механизмов микробиологической трансформации металлов и разработка технологий очистки от тяжелых металлов с использованием микроорганизмов;
·            разработка технологий и бактериальных препаратов для микробиологической очистки водоемов, почвы и промышленных стоков от нефтяных загрязнений;
·            разработка микробиологических средств защиты растений;
·            создание препаратов пробиотиков для профилактики и лечения кишечных инфекций и дисбактериозов у людей и сельскохозяйственных животных;
·            поиск и изучение новых антибиотиков, повышение активности продуцентов известных антибиотиков;
·            изучение проблем длительного сохранения промышленно ценных штаммов микроорганизмов, повышения активности биологически активных веществ, сохранения и пополнения коллекционных фондов микроорганизмов;
·            изучение процессов циркуляции вирусов гриппа человека, животных и птиц, парамиксовирусов и коронавирусов на территории Республики Казахстан;
·            выделение вирусов от гриппа, парамиксовирусов и коронавирусов от человека, животных и птиц, их вирусологический, молекулярный и филогенетический анализ, изучение механизмов передачи вирусов от животных и птиц к человеку, изчуение возможности возникновения новых эпидемически значимых штаммов;
·            совершенствование методов иммунодиагностики и молекулярной диагностики вирусных инфекций, разработка усовершенствованных тест-систем для экспресс-диагностики вирусных инфекций;
·            изучение механизмов патогенного действия вирусов и их структурных компонентов на клеточные структуры и органы;
·            разработка противовирусных вакцин нового поколения с использованием молекулярных технологий и нанотехнологий;
·            разработка новых иммуностимулирующих препаратов и адъювантов для повышения эффективности противовирусных вакцин;
·            разработка новых лечебных и профилактических антивирусных препаратов растительного и микробного происхождения для лечения и профилактики вирусных инфекций.